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        1. 首頁 / NGS測序 / 產(chǎn)品應(yīng)用詳情

          杜絕走彎路!NGS文庫構(gòu)建關(guān)鍵原料一站式解決方案來襲!

          NGS因其檢測靈敏度高,特異性強(qiáng)且兼具定性和定量檢測,在病原檢測、腫瘤突變檢測、生殖遺傳等領(lǐng)域展現(xiàn)了極為廣闊的臨床與科研應(yīng)用前景。文庫構(gòu)建作為NGS測序的核心步驟,直接影響測序質(zhì)量?;贗VD產(chǎn)品的注冊審查指導(dǎo)原則,需要提供主要原材料的研究性資料,結(jié)合原材料基本信息、參數(shù)指標(biāo)及供應(yīng)來源等因素綜合分析并驗(yàn)證,確定最適的原材料來源。常規(guī)DNA和RNA建庫流程主要包含cDNA合成、DNA片段化、接頭連接和文庫擴(kuò)增等關(guān)鍵步驟,各步驟包含的原料酶種類較多,原料酶篩選一定程度上拉長了研發(fā)周期。在此基礎(chǔ)上,高性價(jià)比、簡潔的建庫模塊產(chǎn)品成就IVD產(chǎn)品開發(fā)的新選擇。

           

          圖1.DNA常規(guī)建庫流程(左)和RNA建庫流程(右),Illumina平臺(tái)為例

           

           

          高效cDNA合成模塊

           

          利器在手,事半功倍

          逆轉(zhuǎn)錄合成是RNA-Seq的核心環(huán)節(jié),高靈敏度、cDNA高產(chǎn)量、可兼容復(fù)雜結(jié)構(gòu)模板等兼具多功能于一體的新型高效率逆轉(zhuǎn)錄酶是心之所向。翌圣ZymeEditor™酶改造平臺(tái)通過對M-MLV進(jìn)行定向改造獲得了性能全方面提升的全能型逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)品,可兼具RNA-seq、單細(xì)胞測序、cDNA克隆和文庫構(gòu)建等多個(gè)應(yīng)用場景。

           

          圖2.13488ES應(yīng)用于RNA-seq性能

           

          OnePot 系列DNA打斷模塊

           

          新晉熱門,將優(yōu)化進(jìn)行到底

          受限于平臺(tái)測序讀長短的不足,建庫前DNA需要進(jìn)行隨機(jī)打斷。早期酶法片段化因打斷均一性、偏好性問題讓人望而卻步,翌圣生物匠心研發(fā),優(yōu)化開發(fā)出兩款特色片段化酶,37℃ 3-30 min作用的劇烈打斷酶和30℃ 10-40 min的溫和打斷酶?;陔S機(jī)打斷的酶法片段化產(chǎn)品逐步改善短板,組合成滿足不同樣本、不同測序類型等眾多需求的DNA片段化、末修和加A的模塊產(chǎn)品。

           

          圖3. 不同DNA片段化酶作用于DNA的打斷效果:劇烈打斷酶(左)和溫和打斷酶(右)

           

          T4 DNA高效連接模塊

           

          生物界的“502”

          文庫轉(zhuǎn)化率是評估文庫質(zhì)量的重要指標(biāo),文庫轉(zhuǎn)化率高一定程度上意味著文庫豐富度、測序數(shù)據(jù)均一性更好。常規(guī)T4 DNA 連接酶側(cè)重優(yōu)化高效率連接但易出現(xiàn)片段自連,從而降低文庫轉(zhuǎn)化率,影響文庫豐富度與測序質(zhì)量。翌圣ZymeEditor™酶改造平臺(tái)對T4 DNA Ligase進(jìn)行定向改造獲得新型突變體,搭配精心優(yōu)化的連接Buffer,開發(fā)出熱穩(wěn)定性高、片段自連率低的接頭連接模塊產(chǎn)品,大大提高文庫轉(zhuǎn)化率。

           

          圖4.12996ES熱穩(wěn)定性和接頭殘留分析

           

           

          熱啟動(dòng)高保真酶

           

          專為NGS設(shè)計(jì)而生

          NGS文庫制備方法都需要用到PCR擴(kuò)增酶,大多數(shù)高保真DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶結(jié)活性和3'→5'外切酶的活性,可沿5'→3'方向合成DNA的同時(shí)糾正錯(cuò)誤摻入的堿基,從而快速、高保真的擴(kuò)增DNA片段。但很少有酶是專為NGS設(shè)計(jì)的,高效、準(zhǔn)確、特異且能夠無偏倚地?cái)U(kuò)增不同大小和GC含量的靶點(diǎn),同時(shí)又具備可提前預(yù)混引物的文庫擴(kuò)增產(chǎn)品選擇性并不多。翌圣生物開發(fā)出含有獨(dú)特設(shè)計(jì)的超高保真DNA聚合酶及經(jīng)過優(yōu)化的熱啟動(dòng)PCR預(yù)混液,其專門針對高效、高保真和低偏好的NGS文庫擴(kuò)增,應(yīng)對復(fù)雜NGS文庫擴(kuò)增的挑戰(zhàn)。

           

          圖5.12980ES穩(wěn)定性和擴(kuò)增錯(cuò)誤率分析

           

          除了以上一系列NGS建庫模塊產(chǎn)品外,我們還提供一站式的原酶產(chǎn)品,以滿足不同客戶的組合化需求。翌圣NGS建庫原料產(chǎn)品經(jīng)過嚴(yán)格的出廠質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),嚴(yán)格的批次性能和穩(wěn)定性質(zhì)控,讓您建庫無憂。

           

          翌圣

           

          NGS建庫模塊和單酶產(chǎn)品選擇指南

          產(chǎn)品類別

          產(chǎn)品名稱

          貨號

          備注

          高效cDNA合成

          Hifair® Ultra Reverse Transcriptase(200 U/μL)

          14604ES

          逆轉(zhuǎn)錄單酶

          Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit

          13488ES

          cDNA合成模塊

          DNA片段化/末修/加A

          Hieff® Smerase V2

          13588ES

          DNA打斷酶(劇烈型)

          Hieff® Smearase V3

          12945ES

          DNA打斷酶(溫和型)

          Hieff NGS® OnePot Pro DNA Fragmentation Reagent V3

          12954ES

          DNA打斷/末修/加A模塊

          末修加A

          Hieff NGS® C175P2 Endprep Module

          12985ES

          末修加A模塊

          接頭連接

          Hieff® Versatile T4 DNA Ligase (600 U/µL)

          12996ES

          T4 DNA連接單酶

          Hieff® Rapid Ligation Mix

          12999ES

          DNA連接模塊

          文庫擴(kuò)增

           

          2× Ultima HF Amplification Mix

          13344ES

          高保真酶

          2× Hieff Canace® Pro Amplification Mix

          12980ES

          熱啟動(dòng)文庫擴(kuò)增模快

           

           

           

          400-6111-883