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        1. Hieff Mut? Multi Site-Directed Mutagenesis Kit多點突變試劑盒

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          產(chǎn)品說明書

          FAQ

          COA

          已發(fā)表文獻

          產(chǎn)品描述

          Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit 是基于Hieff Clone® 快速克隆技術(shù)的定點突變系統(tǒng)。使用本試劑盒,可一次性向目標質(zhì)粒上三至五個不連續(xù)位點(相距超過50bp)同時引入定點突變。該試劑盒由兩個模塊組成:Hieff® II Pfu DNA Polymerase擴增模塊和Hieff Clone® 快速克隆模塊。Hieff® II Pfu DNA Polymerase超高的保真度顯著降低了擴增過程中引入新突變的可能性,其卓越的長片段擴增能力,廣泛適用于長度小于20 kb的任何質(zhì)粒擴增。Hieff Clone®快速克隆系統(tǒng)利用高效的同源重組反應替代傳統(tǒng)的退火成環(huán)反應。因此使用Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit進行DNA定點突變時,引物設(shè)計更加靈活,且擴增反應以指數(shù)方式進行,極大減少了模板使用量,有利于原始甲基化模板的徹底降解。

          Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit中的重組酶Exnase MultiS經(jīng)過優(yōu)化,專門針對多堿基進行定點突變。此外,如擴增產(chǎn)物特異,其DpnI消化產(chǎn)物可不進行DNA純化而直接用于重組反應。高度優(yōu)化的反應緩沖液、快捷的操作流程以及極高的成功率,使得Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit成為DNA多點突變試劑盒。


          應用范圍

          DNA定點突變

          注:如使用本品對質(zhì)粒進行定點突變,請使用甲基化酶無缺陷的宿主菌 (例如Top10、DH5α、JM109)擴增原始質(zhì)粒!


          產(chǎn)品組成

          編號

          組分

          產(chǎn)品編號/規(guī)格

          11004ES10 (10 T)

          11004-A

          2×Hieff® II PCR buffer

          1.25 mL

          11004-B

          dNTP Mix (10 mM each)

          50 μL

          11004-C

          Hieff® II Pfu DNA Polymerase (1 U/μL)

          50 μL

          11004-D

          Dpn I (10 U/μL)

          50 μL

          11004-E

          2× Hieff Clone® MultiS Enzyme Premix

          100 μL


          運輸與保存方法

          冰袋(wet ice)運輸。產(chǎn)品-20℃保存。有效期1年。

          不連續(xù)多堿基(相距超過50bp)定點突變實驗流程(以不連續(xù)三堿基為例)

          實驗流程概覽(圖一)

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          圖一:使用Hieff Mut™ Multi Site-Directed Mutagenesis Kit進行不連續(xù)三堿基定點突變實驗流程

          1. 引物設(shè)計

          向質(zhì)粒三個不連續(xù)位點引入定點突變,只需設(shè)計三對引物將質(zhì)粒分段擴增即可。引物設(shè)計基本原則為:在每個待突變位點處設(shè)計部分反向互補的擴增引物對。每對正反向引物5’端包含15-21 bp反向互補區(qū)域(GC含量40%-60%為佳),各引物待突變位點至引物3’端區(qū)域Tm值高于60℃為佳。所需引入突變可以包含在互補區(qū)域內(nèi) (需要兩條引物上均引入點突變),也可以包含在任一條引物的非互補區(qū)域 (只需在一條引物上引入點突變),請勿將突變位點置于引物末端。以向pUC18引入三堿基突變?yōu)槔镌O(shè)計具體方案如圖二所示。

          55.png 

          圖二:向質(zhì)粒引入不連續(xù)多堿基定點突變引物設(shè)計示意圖

          注:待突變位點B、C處的正反向擴增引物設(shè)計方式與位點A 處的引物設(shè)計方式一致。計算引物Tm值時,應計算待突變位點至引物3’端這一區(qū)域內(nèi)的堿基,待突變位點至引物5’端區(qū)域內(nèi)的堿基不應參與計算。

          2. 目標質(zhì)粒分段擴增

          以待突變位點A、B、C為界,將質(zhì)粒分為AB、BC段和CA段。使用Hieff® II Pfu DNA Polymerase對各段分別進行擴增。AB段擴增引物對為:待突變位點A正向擴增引物和待突變位點B反向擴增引物;BC段擴增引物對為:待突變位點B正向擴增引物和待突變位點C反向擴增引物;CA段擴增引物對為:待突變位點C正向擴增引物和待突變位點A反向擴增引物。

          2.1 配制PCR反應體系
          反應各組分解凍后請充分搖勻,使用完畢后及時放回-20℃。2×Hieff® II PCR buffer請勿長時間敞口放置。
          為了增加擴增特異性,反應體系配制過程請于冰水浴中進行。為了防止Hieff® II Pfu DNA Polymerase的校對活性降解引物,請將聚合酶最后加入反應體系中。

          推薦反應體系如下:

          ddH2O

          Up to 50 μL

          2×Hieff® II PCR buffer

          25 μL

          dNTP Mix (10 mM each) a

          1 μL

          模板DNA b

          Optional

          引物1 (10 μM)

          2 μL

          引物2 (10 μM)

          2 μL

          Hieff® II Pfu DNA Polymerase (1 U/μL) c

          1 μL

          a. 請勿使用dUTP和帶有尿嘧啶的引物或模板。
          b 在各片段能正常擴增的前提下,應盡量減少質(zhì)粒模板使用量,推薦≤1 ng。待擴增質(zhì)粒長期放置、反復凍融會導致模板質(zhì)粒斷裂、開環(huán)或降解,因此推薦使用新鮮制備的質(zhì)粒作為模板。
          c. 推薦的酶的終濃度為1 U/50 μl反應??蓪ieff® II Pfu DNA Polymerase在0.5-2 U/50 μl之間進行優(yōu)化,但不要超過2 U/50 μl,尤其當擴增子長度大于5 kb時。

           

          2.2 PCR擴增反應

          推薦PCR反應條件:

          循環(huán)步驟

          溫度

          時間

          循環(huán)數(shù)

          預變性

          95℃

          30 sec

          1

          變性a

          退火b

          延伸c

          95℃

          60℃~72℃

          72℃

          15 sec

          15 sec

          30-60 sec/kb

          30 d

          徹底延伸

          72℃

          5 min

          1

          a. 對于大多數(shù)質(zhì)粒,變性溫度使用95℃即可。

          b. Hieff® II Pfu DNA Polymerase能夠促進模板和引物高效退火。一般來說,退火溫度設(shè)置為引物Tm值即可。如果需要,可以建立一個溫度梯度反應去尋找引物模板結(jié)合的最適溫度。退火時間太長可能導致擴增產(chǎn)物在膠上呈現(xiàn)彌散狀。

          c. 對于大多數(shù)擴增反應,延伸過程可在72℃進行。長的延伸時間有助于提高擴增產(chǎn)量。

          d. 為了防止擴增過程中引入非目標突變,強烈建議擴增循環(huán)數(shù)≤35。如果擴增效率良好的話,推薦擴增循環(huán)數(shù)應≤30。

          反應結(jié)束后取少量擴增產(chǎn)物進行瓊脂糖電泳檢測。如目標質(zhì)粒正確擴增,則可進行下步實驗。

          3. 擴增產(chǎn)物DpnI消化,去除甲基化模板質(zhì)粒
          因上述擴增產(chǎn)物中包含原始模板質(zhì)粒,為防止其在轉(zhuǎn)化后形成假陽性轉(zhuǎn)化子,必須在進行重組環(huán)化之前進行DpnI消化。

          推薦反應體系如下:

          DpnI

          1 μL

          擴增產(chǎn)物

          40~50 μL

          將上述反應體系置于37℃恒溫反應1~2小時。如產(chǎn)物擴增特異,產(chǎn)物條帶單一,DpnI消化產(chǎn)物無需純化,可直接用于后續(xù)重組反應。如擴增不特異,DpnI消化結(jié)束后應膠回收純化目標擴增產(chǎn)物。

          4. 重組反應

          4.1 配制重組反應體系

          質(zhì)粒AB、BC和CA段擴增產(chǎn)物末端分別包含相對應的完全一致的一段序列,因此在Exnase MultiS催化下三擴增產(chǎn)物末端可以發(fā)生同源重組,完成擴增產(chǎn)物環(huán)化過程。于冰水浴中,將下列組分依次加到無菌的1.5 ml Eppendorf管或PCR管的管底。如果不慎將液體粘在管壁,請務(wù)必通過短暫離心使其沉入管底。體系配制完成后,用移液器上下輕輕吹打幾次混勻各組分,避免產(chǎn)生氣泡 (請勿劇烈震蕩或者渦旋混勻)。

          ddH2O

          Up to 20 μL

          AB段DpnI消化產(chǎn)物

          x ng

          BC段DpnI消化產(chǎn)物

          x ng

          CA段DpnI消化產(chǎn)物

          x ng

          2× Hieff Clone® MultiS Enzyme Premix

          10 μL

          Exnase MultiS多點突變重組反應體系最適DNA使用量為每片段0.03 pmol。該摩爾數(shù)對應的DNA質(zhì)量可由以下公式粗略計算獲得:

          DpnI消化產(chǎn)物最適使用量 = [0.02 × 目標質(zhì)粒堿基對數(shù)] ng (0.03 pmol)

          例如,AB段長度為1 kb,BC段長度為2 kb,CA段長度為5 kb。則DpnI消化產(chǎn)物最適使用量為:AB段0.02 × 1000 = 20 ng;BC段0.02 × 2000 = 40 ng;CA段0.02 ×5000 = 100 ng。 

          注:DNA量太多或者太少都將降低環(huán)化效率。常用的吸光度測量法極易受DNA純度、DNA稀釋液pH等因素影響,測定值和DNA實際濃度往往偏差較大。因此,請務(wù)必通過瓊脂糖電泳預先確認DNA濃度,盡量嚴格按照推薦量配制反應體系。當DpnI消化產(chǎn)物最適使用量計算值不足10 ng或者超過200 ng時,加入10ng或200 ng即可。DpnI消化產(chǎn)物不純化直接用于重組反應時,使用量不應超過反應總體積的1/5,即4μl。

          4.2 重組反應

          1)將上述體系置于50℃反應 20-50 min。

          2)待反應完成后,立即將反應管置于冰水浴中冷卻5 min。

          3)之后,反應產(chǎn)物可直接進行轉(zhuǎn)化;也可儲存于-20℃,待需要時解凍轉(zhuǎn)化。

          5. 反應產(chǎn)物轉(zhuǎn)化、涂板、克隆鑒定

          1)取10 μl冷卻反應液,加入到100 μl感受態(tài)細胞中,輕彈管壁數(shù)下混勻,在冰上放置30 min。

          2)42℃熱激45~90秒,冰水浴孵育2 min。

          3)加入900 μl SOC或LB培養(yǎng)基,37℃孵育10min充分復蘇。

          4)37℃搖菌45 min。

          5)取100 μl菌液均勻涂布在含有適當抗生素的平板上。將平板倒置,于37℃過夜培養(yǎng)。

          注:我們推薦您使用轉(zhuǎn)化效率>108 cfu/μg的感受態(tài)細胞。如果感受態(tài)轉(zhuǎn)化效率<108 cfu/μg (例如用CaCl2法新鮮制備的感受態(tài)轉(zhuǎn)化效率通常在106-107 cfu/μg之間),請將培養(yǎng)菌液在5,000 rpm離心3 min收集菌體,用100 μl LB培養(yǎng)基重懸后全部涂板。


          注意事項

          1)引物設(shè)計時5’端反向互補區(qū)盡量選擇無重復序列,且GC含量比較均勻的區(qū)域。當這一區(qū)域內(nèi)GC含量在40%~60%范圍之內(nèi)時,重組環(huán)化效率將達到最大。如這部分區(qū)域GC含量高于70%或者低于30%,重組環(huán)化效率會受到較大影響。

          2)當兩突變位點相距小于50bp時,應將其視為一個突變位點,將兩突變引入同一條/對引物進行實驗。

          3)DpnI只能識別甲基化DNA,請務(wù)必使用從甲基化酶無缺陷的宿主菌中擴增的質(zhì)粒作為PCR模板。

          4)質(zhì)粒PCR擴增結(jié)果需高度特異,雜帶較多會影響實驗結(jié)果。
          5)重組反應體系中應盡量避免金屬絡(luò)合劑(如EDTA)的帶入。因此,建議將DNA純化產(chǎn)物溶解在pH8.0的ddH2O中保存(常規(guī)膠回收試劑盒中的洗脫液可用pH8.0的ddH2O替代),請勿使用TE進行DNA保存。
          6)冷卻后的反應產(chǎn)物應在1h內(nèi)進行轉(zhuǎn)化,且轉(zhuǎn)化前保持在冰水浴中。如需儲存,于-20℃凍存。盡量避免室溫較長時間放置或4℃長期儲存。
          7)反應產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化體積不應超過感受態(tài)細胞體積的1/10,否則會降低轉(zhuǎn)化效率。另外,當轉(zhuǎn)化的DNA濃度太高時,會抑制轉(zhuǎn)化反應。將重組反應產(chǎn)物稀釋5倍后取1/5進行轉(zhuǎn)化。

          8)為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
          9)本產(chǎn)品僅作科研用途!


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          HB211209

          400-6111-883