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        1. Hifair? Precision sgRNA Synthesis Kit

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          產(chǎn)品說明書

          FAQ

          COA

          已發(fā)表文獻(xiàn)

          RNA純化方案

           

          CRISPR/Cas9是一種由RNA指導(dǎo)Cas核酸酶對靶向基因進(jìn)行特定DNA修飾的技術(shù),源于細(xì)菌和古細(xì)菌為應(yīng)對噬菌體和外源質(zhì)粒的攻擊而演化來的一種獲得性免疫防御機(jī)制。在現(xiàn)代生物技術(shù)研究中,此系統(tǒng)是通過人工優(yōu)化的具有引導(dǎo)作用的sgRNA(Single Guide RNA)引導(dǎo)核酸酶Cas9蛋白在與sgRNA配對的靶位點(diǎn)處剪切雙鏈DNA,從而引起DNA斷裂。由于生物體內(nèi)非同源末端修復(fù)機(jī)制或同源重組機(jī)制修復(fù)DNA,導(dǎo)致基因移碼突變、替換或刪除,致使基因功能喪失。

          Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit采用T7 RNA聚合酶混合物高效轉(zhuǎn)錄spCas9 sgRNA。本試劑盒含有能被Cas9蛋白識別并起支架作用的特異性序列,該序列的一部分能與使用者設(shè)計(jì)的目標(biāo)特異序列部分重疊。退火形成互補(bǔ)鏈后由DNA聚合酶進(jìn)行填充。最終生成用于轉(zhuǎn)錄的dsDNA模板。本試劑盒利用其提供的試劑和使用者自己設(shè)計(jì)的特異性DNA序列,單管反應(yīng)可在4小時內(nèi)獲得20-100μg具有功能的sgRNA。


          產(chǎn)品組分

           

          編號

          組分

          產(chǎn)品編號/規(guī)格

          11355ES25

          (25 T)

          11355ES50

          (50 T)

          11355ES60

          (100 T)

          11355-A

          10×sgRNA Enzyme Mix

          50 μL

          100 μL

          200 μL

          11355-B

          10×sgRNA Reaction Buffer

          50 μL

          100 μL

          200 μL

          11355-C

          2×Canace Enzyme Mix

          312.5 μL

          625 μL

          1.25 mL

          11355-D

          Scaffold Template

          31.25 μL

          62.5 μL

          125 μL

          11355-E

          NTPs(25mM each)

          200 μL

          400 μL

          800 μL

          11355-F

          Control sgRNA Oligo(10μM)

          10 μL

          20 μL

          40 μL


          運(yùn)輸儲存方法

           

          干冰運(yùn)輸。-20℃保存,有效期兩年。


          注意事項(xiàng)

           

          1. 反應(yīng)體系中須嚴(yán)格注意不要混入RNase。

          2. 實(shí)驗(yàn)器材(如:槍頭、產(chǎn)品管等)注意嚴(yán)格使用 RNase Free用品。

          3. 為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。

          4. 本產(chǎn)品僅作科研用途!

           

          合成原理

          1600753268611612.png
           


          操作流程

           

          1. 上游引物(Target-specific sgRNA oligo)設(shè)計(jì)

          A. 引物的5’端:T7啟動子序列加保護(hù)堿基(20nt:TTCTAATACGACTCACTATA)

          B. 轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn):添加0~2個G,添加G的個數(shù)由靶序列的5’端決定,T7啟動子至少需要2個G才能有效轉(zhuǎn)錄。

          (注:若特異靶序列已經(jīng)存在2個G,則不需要額外添加,額外的G會降低剪切效率。)

          C. 特異的sgRNA靶序列(20nt):靶DNA序列PAM(NGG)的5’端20nt堿基序列。

          D. 引物的3’端:Scaffold Template退火序列(14nt:GTTTTAGAGCTAGA)。

          示例: 

          DNA模板:

           圖片.png

          上游引物Target-specific sgRNA oligo):

           

          圖片.png

          2. sgRNA合成

          A.sgRNA模板擴(kuò)增

          ①按下列體系配制反應(yīng)體系:

          組分

          體積(μL)

          終濃度

          RNase free H2O

          Up to 25

          -

          Scaffold Template

          1.25

          -

          sgRNA Oligo(10μM)

          1.25

          0.5μM

          2×Canace Enzyme Mix

          12.5

          注: 1. Scaffold Template已預(yù)先與下游引物混合。

          2. 使用試劑、容器等無RNase污染。

          ②PCR反應(yīng)程序:

          循環(huán)步驟

          溫度

          時間

          循環(huán)數(shù)

          變性

          98℃

          10s

          30

          延伸

          68℃

          10s

          保持

          4℃

           

          ③電泳檢測:

          使用2%瓊脂糖膠,5μL PCR反應(yīng)液電泳檢測條帶大小及亮度,用100bp DNA Ladder(貨號:10507)標(biāo)定,其大小為120bp左右單一條帶。

          B.體外轉(zhuǎn)錄sgRNA

          ①按下列體系室溫配制反應(yīng)體系:

          組分

          體積(μL)

          終濃度

          RNase free H2O

          Up to 20

          -

          10×sgRNA Reaction Buffer

          2

          NTPs (25 mM each)

          8

          10 mM each

          sgRNA模板(上述A獲得)

          5

          -

          10×sgRNA Enzyme Mix

          2

          注: 1. 低溫配置可能引起DNA模板沉淀。

          2. 使用試劑、容器等無RNase污染。

          ②反應(yīng)程序:

          溫度

          時間

          37℃

          4h

          4℃

          注:反應(yīng)于PCR儀中進(jìn)行,熱蓋打開,防止長時間導(dǎo)致反應(yīng)液蒸發(fā)。

          DNA模板消化:

          反應(yīng)完成后,每管加入2μL DNaseⅠ(RNase free),37℃孵育15min以去除模板DNA。

          ④轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物純化:

          體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物可選用 RNA Cleaner 磁珠進(jìn)行純化(貨號:12602),也可以采用酚/氯仿純化法(具體操作步驟可聯(lián)系Yeasen索?。?,以去除蛋白、游離的核苷酸等。

          HB200916

          400-6111-883