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        1. 干貨|DNA電泳優(yōu)化寶典,讓條帶清晰可見!

           

          核酸電泳是分子生物學(xué)研究中的一項基本技術(shù),廣泛應(yīng)用于基因克隆、DNA指紋分析、RNA表達(dá)研究等領(lǐng)域。這項技術(shù)的核心在于利用電場驅(qū)動DNA或RNA分子通過凝膠基質(zhì),實(shí)現(xiàn)不同大小分子的分離。盡管核酸電泳的原理相對簡單,但其往往影響最終的成果展示。所以在實(shí)際操作過程中,如何提高電泳效率、獲得更清晰的條帶一直是研究人員追求的目標(biāo)。小翌將分享一些實(shí)用的實(shí)驗(yàn)室小竅門,以幫助各位科研小伙伴們提高電泳效率~

           

          電泳槽

           

           

          小竅門1
           

          選擇合適的凝膠濃度和電泳緩沖液

          凝膠濃度對電泳分離效率有著直接影響。瓊脂糖是最常用的凝膠材料,其濃度通常在0.7%至2%之間選擇。濃度越高,凝膠的分子孔徑越小,DNA遷移速率越慢,但分辨率越高。反之,濃度越低,DNA遷移速率越快,但分辨率較低。電泳緩沖液的組成對DNA的遷移速度和分離效率同樣重要。因此,針對實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟煌?,選擇合適的凝膠濃度與適配的電泳緩沖液。

           

          瓊脂糖濃度

          有效分離范圍(bp)

          推薦緩沖液

          0.5%

          2,000-50,000

          1×TAE

          0.8%

          800-10,000

          1×TAE

          1.0%

          400-8,000

          1×TAE

          1.2%

          300-7,000

          1×TAE

          1.5%

          200-3,000

          1×TAE/0.5×TBE

          2.0%

          100-2,000

          1×TAE/0.5×TBE

          3.0%

          25-1,000

          0.5×TBE

           

           

          TAE緩沖液

          TAE緩沖液含有乙酸(Acetic acid)、EDTA和Tris,適合用于快速電泳和大片段DNA的分離。乙酸的存在降低了凝膠的pH值,有助于提高電泳速度。

           
           
           
           

          TBE緩沖液

          TBE緩沖液含有硼酸(Boric acid)、EDTA和Tris,其離子強(qiáng)度較高,適合用于小片段DNA的高分辨率分離。硼酸根離子的存在增強(qiáng)了凝膠的穩(wěn)定性,有助于提高分離效率。因此凝膠濃度越大,需采用TEB緩沖液,便于分離條帶。

           
           
           

           

          小翌有多種瓊脂糖,適合不同的應(yīng)用場景,供大家選擇~

           

           

           

          小竅門2
           

          樣品準(zhǔn)備

           

          DNA純化

          確保DNA樣品的純度,避免蛋白質(zhì)、多糖和其它雜質(zhì)的污染,這可以通過適當(dāng)?shù)募兓襟E實(shí)現(xiàn)。純化的DNA樣品能夠提供清晰的電泳條帶,減少背景干擾。

           
           
           
           

          DNA Marker

          選擇背景干凈、帶型穩(wěn)定、大小精準(zhǔn)的DNA Marker,如翌圣GoldBand系列DNA Marker(Cat#10501ES-10518ES)。

           

           
           
           

           

           

          小竅門3
           

          均勻加樣

           

          加樣技巧

          使用加樣器時保持平穩(wěn),右手執(zhí)移液槍,左手扶在移液槍前方細(xì)柄處,斜角45℃懸空插入點(diǎn)樣孔中2-3 mm處點(diǎn)樣。盡量避免戳破凝膠,避免樣品接觸凝膠表面,減少樣品擴(kuò)散。均勻的加樣能夠確保DNA片段在凝膠中的一致遷移,避免條帶扭曲或模糊。

           
           
           
           

          加樣量

          控制適當(dāng)?shù)募訕恿?,過量的樣品會導(dǎo)致條帶模糊。適量的加樣能夠保證條帶的清晰度和可讀性,其上樣量與核酸電泳制膠時的梳子大小相關(guān)。

           

          梳子厚度mm

          梳子孔寬mm

          每孔最大上樣量μL)

          推薦上樣量(μL)

          1.0

          ~3

          ~15

          5-10

          1.5

          ~4.2

          ~25

          10-15

          1.5

          ~7

          ~50

          20-40

          2.0

          ~1.5

          ~200

          80-150

           
           
           

           

           

          小竅門4
           

          電泳條件

           

          電壓控制

          根據(jù)凝膠長度和厚度調(diào)整電壓,過高的電壓會導(dǎo)致熱量積累,影響DNA的遷移。適宜的電壓設(shè)置有助于保持恒定的電泳速度,避免條帶扭曲。

           
           
           
           

          恒壓電泳

          優(yōu)先選擇恒壓電泳而非恒流電泳,以保持電場強(qiáng)度的穩(wěn)定。恒壓電泳能夠減少電泳過程中的熱效應(yīng),提高分離效率。但需注意電壓控制在110-130v為佳,過高電壓易造成不穩(wěn)定脈沖,影響電泳效果。

           

          電壓過高造成的條帶模糊

           
           
           

           

           

          小竅門5
           

          預(yù)電泳

          如果是新鮮配制的緩沖液,在加樣前進(jìn)行預(yù)電泳,可以清除凝膠中的雜質(zhì)和氣泡,平衡凝膠孔隙中的離子濃度,減少樣品遷移過程中的阻力,提高電泳效率。預(yù)電泳時間一般建議5-10分鐘。

           

           

          小竅門6
           

          使用新鮮凝膠

           

          避免重復(fù)使用

          重復(fù)使用的凝膠可能會因緩沖液的滲入而改變孔隙大小,影響分離效果。新鮮凝膠能夠提供一致的孔隙率,保證電泳結(jié)果的可重復(fù)性。

           

           

          小竅門7
           

          核酸染料的選擇

           

          安全染料

          使用YeaRed(Cat#10202ES)或YeaGreen(Cat#10204ES)無毒核酸染料,避免使用EB等有毒染料,減少紫外光暴露風(fēng)險。安全染料不僅對操作人員更安全,而且對環(huán)境的影響更小。

           

           
           
           

           

          小翌希望通過上述小竅門的實(shí)施,可以幫助大家顯著提高核酸電泳的分離效率和結(jié)果的清晰度,進(jìn)一步提高實(shí)驗(yàn)的效率和安全性~

           

           

          產(chǎn)品推薦

           

          產(chǎn)品名稱

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          YeaRed 核酸染料(10,000×水溶液)

          10202ES76

          500 μL

          YeaGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000×in Water) 核酸染料

          10204ES76

          500 μL

          Agarose瓊脂糖

          10208ES60/76

          100 g/500 g

          GoldBand DL2,000 DNA Marker

          10501ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand DL600 DNA Marker

          10502ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand DL5,000 DNA Marker

          10504ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand DL10000 DNA Marker

          10505ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand 100 bp DNA ladder

          10507ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand 1 kb DNA ladder

          10510ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand Full-Scale DNA Ladder

          10511ES80

          1 mL

          GoldBand 15000 DNA Marker

          10512ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand 50bp DNA Ladder

          10515ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand 100bp plus DNA Ladder

          10516ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand 200 bp DNA Ladder

          10517ES60/80

          100 T/10×100 T

          GoldBand 500 bp DNA Ladder

          10518ES60/80

          100 T/10×100 T

           

           

           

          400-6111-883